本系以綠色化學為理念，並朝材料與藥物之開發、分析與應用為發展重點特色，研究重點包括高科技化學分析技術之研發與應用、藥物及生物活性化合物之研發與應用、材料及特用化學品之研發與應用、染料敏化太陽能電池之研發與應用。

1. 高科技材料之研發與物性探討-能源科技、奈米材料、觸媒材料、化學感測器、界面活性劑
2. 生物活性化合物之研發與探討-合成藥物、天然藥物、昆蟲誘引劑
3. 高科技化學分析技術之研發與應用-雷射光譜法、化學感測技術、綠色萃取技術、電泳法、質譜法、層析法